Centrum Pediatrii im. Jana Pawła II powstało na bazie od dawna istniejących w Sosnowcu dwóch szpitali dziecięcych: Szpitala nr 3 o profilu ogólnopediatrycznym przy ul. Grota Roweckiego oraz Szpitala nr 6 o profilu reumatologicznym przy ul. Zapolskiej.
Oba Szpitale mają wieloletnią historię, choć powstały w różnych stuleciach.
Szpital nr 3 powstał w 1862 roku z inicjatywy hrabiego Mycielskiego i jako Szpital Bratniej Pomocy Robotników Bolesławsko-Sosnowickich działał do 1933 roku, kiedy zlikwidowano go na rzecz nowowybudowanego szpitala przy ul.3-go Maja. Ten „Szpital na Lepiankach”, jak potocznie nazwali go mieszkańcy miasta, otwarto ponownie w 1951 roku i zaadaptowano do celów lecznictwa dziecięcego. To w nim w 1957 roku powstał pierwszy na terenie Zagłębia dziecięcy oddział chirurgiczny.