Oddział Kliniczny Pulmonologii usytuowany jest w Krakowie przy ul. Skawińskiej 8. Posiada 46 łóżek o profilu pulmonologicznym, alergologicznym i internistycznym. Strukturę organizacyjną stanowią: Oddział Pulmonologii, Poradnia Przykliniczna Chorób Płuc, Pracownia Bronchoskopii, Pracownia Badań Czynnościowych Układu Oddechowego oraz Gabinet Zabiegowy.
Oddział Kliniczny Pulmonologii Szpitala Uniwersyteckiego w Krakowie jest ośrodkiem referencyjnym dla Polski Południowej. Posiada akredytację do prowadzenia specjalizacji z zakresu chorób wewnętrznych, chorób płuc i alergologii. Na oddziale prowadzi się diagnostykę i leczenie chorób układu oddechowego, w tym także nowotworów, bezdechu sennego oraz chorób rzadkich.